同时建议在国子监增设格物、算学等课程，供有兴趣的监生选修。
“孔卿用心了。”
朱由检合上奏本，目光灼灼道：“但朕要的不是改良，而是变革。”
“孔卿如今也是我大明重臣，平日署理礼部俗物，会同内阁诸臣，处置朝廷繁杂的政事，卿以为，前宋赵普那句半部论语治天下，当真可行吗？”
“朕无数次重申，当今之天下，乃三千年未有之变局，乃真正的大争之世！”
“儒学想要再次兴盛，唯有自我革新。”
“将来才有可能将圣人教化，传至天下。”
“可是陛下……”
孔贞运还想争辩。
“没有可是。”
朱由检抬手打断他：“孔卿，你是圣人之后，当知因时而变的道理。”
“卿平日里闲暇，可以去科学院和医学院看看。”
“看看如何把儒学和如今的大明、如今的天下结合起来。”
孔贞运沉默良久，终于长叹一声：“臣……臣明白了。”
“你明白就好。”
见对方低头，朱由检的语气也缓和下来：“新式科举并非要抛弃儒学，而是要儒学与实学并重。”
“朕已命科学院着手编修新教材，将《几何原本》《泰西水法》《农政全书》等实学著作纳入其中。”
“礼部要做的，是协助这次变革，而不是阻挠。”
“臣……遵旨。”
孔贞运深深一揖，退出殿外。